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2012年11月23日，大铲湾码头（一期）作为全国第一家率先启用海关新舱单管理系统的试点码头，自新系统运行一年多以来，码头运作正常，操作平稳，成效显著，为船公司和进出口企业提供了高效便捷的通关环境。

新舱单管理系统是海关总署依据其2008年发布的《中华人民共和国海关进出境运输工具舱单管理办法》而开发的水运舱单操作平台。自2011年3月28日零时起，海关总署率先在大铲湾海关试点切换新的水运舱单管理系统。

 为保证新舱单系统在大铲湾海关的顺利切换，大铲湾码头（一期）调派相关部门业务骨干成立专项小组，在新系统上线前一个月开始着手各项准备工作，并在系统正式上线后持续监控系统运行情况，实时协助解决海关、船公司及船代公司出现的问题，为新舱单在大铲湾海关实现全面切换打下了结实的基础。 

据海关调查数据显示，自2011年5月26日起，新系统的进出口舱单核销率、运抵正常率及理货正常率均达到100%，没有货物因新舱单系统而延误装船，码头的高效运作得到了进出口客户的一致好评。

另据码头及海关相关电子数据统计显示，新舱单系统的应用可获得进出口企业、码头经营人、海关的三赢局面，具备：企业操作简便快捷、通关效能更高；系统流程整合优化、关企互动更加智能；物流信息获取更早、码头操作效率更高三大优势，而进出口企业则可获得优质企业申报便利、优势明显等九个方面的便利。

在新舱单系统取得良好成效和经验的基础上，2012年11月6日，「监管司舱单管理」、运输工具监管工作专题研讨会”在大铲湾举行，海关总署监管司相关负责人出席研讨会并发言，肯定了新舱单系统在大铲湾海关的运行情况。会上，来自北京、天津、石家庄、大连、上海、宁波、厦门、青岛、广州、黄埔等10个直属海关代表与深圳海关总关及辖区内各海关及报关行、船代、码头企业展开了讨论。与会代表反映，新舱单系统使进出口企业缩短了通关时间、节约了成本；同时，关企信息互动使船代公司掌握了更多主动权；而码头由于可实时获得货物的海关放行信息，其操作效率进一步提高。

基于新舱单系统在大铲湾口岸运行良好，海关总署监管司进一步要求与会各海关加大水运舱单管理系统试点切换工作的力度。