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2012年11月23日，大鏟灣碼頭（一期）作為全國第一家率先啟用海關新艙單管理系統的試點碼頭，自新系統運行一年多以來，碼頭運作正常，操作平穩，成效顯著，為船公司和進出口企業提供了高效便捷的通關環境。

新艙單管理系統是海關總署依據其2008年發布的《中華人民共和國海關進出境運輸工具艙單管理辦法》而開發的水運艙單操作平台。自2011年3月28日零時起，海關總署率先在大鏟灣海關試點切換新的水運艙單管理系統。

為保證新艙單系統在大鏟灣海關的順利切換，大鏟灣碼頭（一期）調派相關部門業務骨干成立專項小組，在新系統上線前一個月開始著手各項準備工作，並在系統正式上線後持續監控系統運行情況，實時協助解決海關、船公司及船代公司出現的問題，為新艙單在大鏟灣海關實現全面切換打下了結實的基礎。

據海關調查數據顯示，自2011年5月26日起，新系統的進出口艙單核銷率、運抵正常率及理貨正常率均達到100%，沒有貨物因新艙單系統而延誤裝船，碼頭的高效運作得到了進出口客戶的一致好評。

另據碼頭及海關相關電子數據統計顯示，新艙單系統的應用可獲得進出口企業、碼頭經營人、海關的三贏局面，具備：企業操作簡便快捷、通關效能更高；系統流程整合優化、關企互動更加智能；物流信息獲取更早、碼頭操作效率更高三大優勢，而進出口企業則可獲得優質企業申報便利、優勢明顯等九個方面的便利。

在新艙單系統取得良好成效和經驗的基礎上，2012年11月6日，「監管司艙單管理、運輸工具監管工作專題研討會」在大鏟灣舉行，海關總署監管司相關負責人出席研討會並發言，肯定了新艙單系統在大鏟灣海關的運行情況。會上，來自北京、天津、石家莊、大連、上海、寧波、廈門、青島、廣州、黃埔等10個直屬海關代表與深圳海關總關及轄區內各海關及報關行、船代、碼頭企業展開了討論。與會代表反映，新艙單系統使進出口企業縮短了通關時間、節約了成本；同時，關企信息互動使船代公司掌握了更多主動權；而碼頭由於可實時獲得貨物的海關放行信息，其操作效率進一步提高。

基於新艙單系統在大鏟灣口岸運行良好，海關總署監管司進一步要求與會各海關加大水運艙單管理系統試點切換工作的力度。